1989年吴作人先生将自己的10万元存款捐赠出来，建成吴作人基金会的原始基金。最近十年中（2000-2009年），基金会总资产从225万元上升到1400万元，增长了5倍多。特别是从2007年开始，基金会进入了快速发展阶段，运作项目增多，2009年的公益事业支出达到130万元，超过了上一年资产总值的11%。吴作人基金会严格遵守《基金会管理条例》的规定，保证每年的公益事业支出不低于上一年资产总值的8%，并将行政支出控制在总支出的10%以内。财务接受年度审计，整体运营接受民政部年检，并将每年度报告公示在国家民间组织管理局主办的“中国社会组织网”（http://www.chinanpo.gov.cn）以及《公益时报》上，接受社会的监督。2010年，基金会在财务方面的总体目标是将总资产规模达到2000万元，公益事业支出也将达到110万元以上。
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